從湖西鄉的沙港村或北寮村等港口出發，位於北寮村東北方約4公里的海面上，有兩座方山台地的島嶼，四周海崖的玄武岩柱狀節理分明，退潮時兩島可以相連，漲潮分開，一千多萬年前從大型熔岩台地(主要是鹼性玄武岩地質)，經過千萬年海蝕和風化作用，才變化成現在的地形地貌一大、一小雞善嶼，已納入玄武岩自然保留區。在這兩座島嶼的玄武岩中均含有橄欖石團塊，是鹼性玄武岩熔岩流常見的共生結晶。



大雞善嶼的東、南、西邊皆可以看到海蝕洞、海蝕溝等地形，東南方則有一處淺水沙灘。小雞善嶼是典型的玄武岩方山小島，長短高低、參差不齊管風琴狀的柱狀玄武岩地貌，有如一管超大型的管風琴矗立碧海藍天中，六角形的節理面、稜角分明、鏗鏘有力，是來澎賞岩、賞鳥的最著名景點。



夏季時，來雞善嶼繁殖的紅燕鷗數量居北海之冠，每年都有一、兩千隻選擇在島上棲息。近年來，澎湖縣野鳥學會曾在雞善嶼進行繫放研究時，根據紅燕鷗腳上的足旗得知，這些紅燕鷗是來自澳洲的東北方。同樣地，澳洲在冬季的繫放工作也發現來自澎湖的紅燕鷗，而且十多年前澎湖鳥會繫放的紅燕鷗，也再回到了澎湖繁殖。可見紅燕鷗每年春、秋兩季便會千里迢迢的往返於澎湖與澳洲之間。



保護保育島嶼景觀，也是保護野生動物的最好方法，近四十年來隨著觀光產業發展，雞善嶼已成為東海旅遊的重要景點。