澎湖海洋地质公园中心，是澎湖县政府针对地质公园所设置的，位于第三渔港旁，与马公市公所只有一条街道之隔。地质中心内有地质公园的介绍，还有澎湖的自然保护区，和猫屿海鸟保护区、七美石器工厂的分布图、澎湖地质年代表、世界各国地质公园、台湾地质公园、石材生活主题、澎湖特色景观、玄武岩的介绍等等，非常丰富详细。
内部空间虽然不大，却分为15区，有：「澎湖玄武岩展示」、「澎湖特色景观」、「玄武岩介绍」、「澎湖地质年代表」、「澎湖六大地质公园」、「澎湖的自然及海鸟保护区」、「七美史石器工厂」、「世界共同的资产」、「石材生活主题」、「视听室」、「图书与石材工艺品」及「互动益智活动」等。
特别的是地质中心的外观主要是以石为主，走的是传统与和式的风格，是非常有特色的建筑。内部分成许多馆区，里头也木制的楼梯，跃层层层往上去，可以站在较高的地方欣赏馆内。里头也有许多地区是提供给小朋友的科学教学的喔！
【建议停留时间】 2小时