施公祠按「施将军庙碑记」，可确证此庙系施琅平台封靖海候后所建之生祠。道光年间加祀海璮殉职之官兵，故不专称将军庙，而改称施公祠。
位于澎湖县马公市中央里中央街的施公祠，原名为「施将军庙」，约建于清康熙23年(公元1684年)。庙里主祀施琅神像，以其任水师提督，有功于清廷，乃建施将军以资纪念，道光二十三年后才易名施公祠。至今已有400多年以上历史，为澎湖地区第三级古迹。
由于施琅将军生前所为有功于清廷，所创下的丰功伟业更是不计其数，受朝廷赏识青睐之，因此清廷特设此庙，以表感念。
施公祠为街屋式狭长型合院之型态，建筑构造由承重墙与山墙式木屋构架所混合构筑而成。除入口外，其余四面皆由密实的空间封闭为其特色，外埕亦不大。
施公祠外侧右前方，有一口井，原名妈宫大井，因有施琅祷于天后而得涌泉之传说，又称施将军井、施井，以井水丰沛可供应万军饮用，也有师泉井、万军井的说法。该井依文化资产法公告为县定古迹。
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