澎湖群岛冬天季风强劲，故先民于锁港筑塔有镇风止煞之意，又锁港四周无高山屏障，先民建双塔于出海要冲，也做为居民海上渔捕时辨识方位的指标。
锁港里为马公市的渔港，盛产小管，渔业相当发达，而后来这个小镇则因小管的闽南语发音被称为「锁港镇」。
锁港石塔由南塔（午塔）及北塔（子塔）二者所组成，位于旧聚落北方，近三层楼高，石塔所在处原有一高起的小丘，为社里的靠山，因强劲的东北季风而逐渐消失，于是当地产生了一句谚语「锁管港了一个山，猪母水了一个湾」，说明社里的沙丘被吹到猪母水（山水）的港湾去了，所以在原址上建筑两座大石塔以弥补靠山的消失，对风水所造成的破坏。
锁港石塔为九层阶梯状的黑石迭砌而成的圆锥形塔，为澎湖石塔中，形式最为古拙者之一。
原为黑石建造，民国五十一年重新修建为黑石水泥材料（由玄武岩、水泥、堆砌而成）。其建积─第一层约六十六平方公尺。原为七层迭形石敢当，于民国五十一年重建后改为九层，为全澎湖最高之石塔，约十四公尺高。
【建议停留时间】 1小时